一、原理不同：
均質機是通過轉子和定子的精密配合，轉子高速平穩的旋轉，形成高頻、強烈的圓周切線速度、角向速度達到均質。
乳化機是通過與發動機連接的均質頭的高速旋轉，對物料進行剪切，分散，撞擊。這樣物料就會變得更加細膩。
二、應用區別：
均質機一般應用在用于生物技術領域的組織分散、醫藥領域的樣品準備、食品工業的酶處理多數用于研究物質。
乳化機一般應用與諸如粘合劑、油漆涂料、化妝品、食品、藥品、塑料樹脂、印染、油墨、瀝青等行業都有廣泛的應用。
三、優缺點區別：
均質機優點是優點是混合效果最好。缺點為功耗大，產量低，容易出現故障，維修成本較高。
乳化機優點是混合效果好，選擇合適的乳化頭可以適用多種工況條件，應用廣泛。缺點為產量低，對硬顆粒物料和高粘度物料，混合效果差。